Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC2Q8N158 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC2Q8N158 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms