Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
IFNL1Q8IU54 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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