Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT28Q7Z3Y7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms