Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP43Q70EL4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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