Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms