Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEM1Q6ZVN7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEM1Q6ZVN7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms