Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP27Q6ZUM4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms