Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms