Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC141Q6ZP82 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms