Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CD109Q6YHK3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms