Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD2Q6NTF9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms