Protein–RNA interactions for Protein: Q685J3

MUC17, Mucin-17, humanhuman

Predictions only

Length 4,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC17Q685J3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MUC17Q685J3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms