Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPH4AQ5TD94 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms