Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A3Q5K4L6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A3Q5K4L6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms