Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SDK2Q58EX2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms