Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF212Q495C1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms