Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms