Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TWISTNBQ3B726 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms