Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FXNQ16595 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FXNQ16595 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FXNQ16595 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FXNQ16595 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FXNQ16595 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FXNQ16595 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FXNQ16595 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FXNQ16595 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FXNQ16595 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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