Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSRP2Q16527 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSRP2Q16527 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSRP2Q16527 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSRP2Q16527 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSRP2Q16527 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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