Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF4Q15306 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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