Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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