Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
R3HDM1Q15032 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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