Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCD11Q14690 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms