Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms