Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGB1Q14028 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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