Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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ITGB3BPQ13352 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB3BPQ13352 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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