Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF5Q13243 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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