Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms