Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CNTN1Q12860 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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CNTN1Q12860 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CNTN1Q12860 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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