Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TROQ12816 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TROQ12816 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TROQ12816 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TROQ12816 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TROQ12816 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROQ12816 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROQ12816 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROQ12816 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROQ12816 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROQ12816 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TROQ12816 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROQ12816 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROQ12816 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TROQ12816 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
TROQ12816 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TROQ12816 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TROQ12816 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms