Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP4Q09028 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms