Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSRP1Q08945 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms