Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4DQ08499 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4DQ08499 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms