Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFF3Q07654 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms