Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms