Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTDSPL2Q05D32 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms