Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms