Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACVR1Q04771 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACVR1Q04771 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACVR1Q04771 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACVR1Q04771 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACVR1Q04771 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACVR1Q04771 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACVR1Q04771 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ACVR1Q04771 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACVR1Q04771 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACVR1Q04771 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms