Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ID3Q02535 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ID3Q02535 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ID3Q02535 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ID3Q02535 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms