Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC10Q01780 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms