Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms