Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RPS29P62273 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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