Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTPAP49638 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTPAP49638 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTPAP49638 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTPAP49638 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTPAP49638 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TTPAP49638 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTPAP49638 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTPAP49638 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTPAP49638 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTPAP49638 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTPAP49638 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTPAP49638 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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