Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms