Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM23P36406 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms