Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD12P35452 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms