Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKBRP32239 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms