Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC27P30260 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC27P30260 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC27P30260 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC27P30260 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC27P30260 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC27P30260 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC27P30260 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC27P30260 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms