Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms